Jobb som matchar bioinformatiker i Uppsala

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl. a cancer, genetiska och autoimmuna sjukdomar. En av de bärande tankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed främja en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom sex forskningsprogram: cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten och det teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet. Institutionen omsätter omkring 550 miljoner kronor, varav ca två tredjedelar är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 400, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 850 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: www.uu.se/medarbetare/institution/immunologi-genetik-och-patologi

Arbetsuppgifter
Arbetsområde: Analyser av proteomik vid klassiskt Hodgkins lymfom (cHL).
Huvudsakliga arbetsuppgifter: Alla för närvarande tillgängliga cHL patients i U-CAN databasen (ca140 patienter) har analyserats med omfattande Olink™ multiplex protein paneler (Oncology, Cardiometabolic, Neurology, Inflammation, 1536 proteiner totalt). Parallellt har kliniska data samlats in. Arbetet omfattar bioinformatik, statistik och deltagande i skrivande. Proteomikdata har korrelerats till inflammation och ska fortsätta korreleras till inflammation och bl a hjärt- och lungbiverkningar. Vid behov kan komplettering göras med till exempel immunhistokemi för verifiering av proteomiska fynd i tumörmaterial.
Arbetsledning: Handledare i arbete är Daniel Molin. Den anställde kommer att arbeta tillsammans med Jeremia Collin och få stöd avseende bioinformatik av Eva Freyhult.

Kvalifikationskrav
Biomedicinare. Färdigheter i och praktisk erfarenhet av programmering, exempelvis i R.
Kunskap om proteomik och praktisk erfarenhet av (självständigt ha genomfört) biostatistiska beräkningar. Kunskaper om lymfom.

Önskvärt och/eller meriterande i övrigt
Specifika kunskaper om proteomik vid lymfom, framförallt Hodgkins lymfom. Självständigt arbete med detta värderas högt, liksom personliga egenskaper.

Om anställningen
Anställningen är tidsbegränsad, 4,5 månader. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Daniel Molin, daniel.molin@igp.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 20 september 2024, UFV-PA 2024/2715.

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitethttps://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/ Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd. Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Anställningsform: särskild visstidsanställning | Anställningens omfattning: heltid | Antal lediga befattningar: 1 | Sysselsättningsgrad: 100% | Ort: Uppsala | Län: Uppsala län | Land: Sweden | Referensnummer: UFV-PA 2024/2715 | Facklig företrädare: Seko Universitetsklubben seko@uadm.uu.se, ST/TCO tco@fackorg.uu.se, Saco-rådet saco@uadm.uu.se, | Publicerat: 2024-09-05 | Sista ansökningsdag: 2024-09-20